/  Новости 

Глубокое мутационное сканирование идентифицирует сайты нуклеопротеина вируса гриппа, влияющие на ингибирование при связывании с факторами MxA человека

Врожденный иммунный фактор рестрикции MxA ингибирует репликацию гриппа путем взаимодействия с вирусным нуклеопротеидом (NP). Вирус гриппа человека более устойчив к ингибированию MxA-факторами, чем вирус птичьего гриппа, и в предшествующих работах сравнивались вирусные штаммы человека и птиц для идентификации аминокислотных различий в NP, которые влияют на чувствительность к MxA. Однако эта стратегия ограничивалась выявлением сайтов в NP, где влияющие на чувствительность к MxA мутации, были зафиксированы в небольшом количестве документированных зоонозных передач гриппа к человеку. Здесь учёные из США применяют метод безошибочного глубокого мутационного сканирования для количественного определения влияния всех одиночных аминокислотных мутаций в NP на чувствительность к MxA-факторам человека в контексте компетентного по репликации вируса. Одновременно были идентифицированы новые сайты в NP, где мутации влияют на устойчивость к MxA и повторно идентифицированы мутации, которые, как уже было известно, повышают устойчивость к MxA при адаптаций гриппа к человеку. Большинство сайтов, где мутации имеют наибольший эффект, почти полностью сохраняются во всех вирусах гриппа А, и аминокислоты в этих сайтах придают относительно высокую устойчивость к MxA. Эти сайты сгруппированы в областях NP, которые, по-видимому, важны для их распознавания с помощью MxA. Авторы демонстрируем мощную стратегию идентификации частей вирусных белков, которые влияют на ингибирование факторами хозяина. 

Ashenberg O., Padmakumar J., Doud M.B., Bloom J.D. 
PLoS Pathog. 2017 Mar 27;13(3):e1006288. doi: 10.1371/journal.ppat.1006288. 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28346537 

Перевод подготовил Михаил Афанасьев
 

Вернуться к списку