Научные сотрудники ФИЦ ФТМ (г. Новосибирск) прошли стажировку в ФГБУ «НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

В период с 13 по 31 мая 2024 года научные сотрудники ФИЦ ФТМ (г. Новосибирск) прошли стажировку в ФГБУ «НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России по дополнительной профессиональной программе – программе повышения квалификации  «Применение платформ Illumina и Oxford Nanopore в секвенировании возбудителей вирусных инфекций» (108 академических часов).

На этапе самообразования было изучено:
Исторические этапы развития секвенирования в мире и России от секвенирования по методу Сэнгера до высокопроизводительного секвенирования на американских и китайских платформах. Сформировано глубокое понимание основных тенденций в области развития молекулярной биологии в целом, геномики и филогении вирусов. Изучены наиболее представительные базы данных, отработан механизм работы с ними и представления результатов согласно современным международным стандартам.

На этапе практики были изучены и освоены умения:
Сборки и преобразования данных, получаемых с таких приборов для высокопроизводительного секвенирования, как Illumina, NextSeq и Oxford, Nanopore, Minion. Была осуществлена работа с таким сборщиком данных, как Kraken. Выравнивание, полученных последовательностей, осуществлялось в программном обеспечении Ugene с использованием референсных последовательностей из базы данных GenBank, NCBI.

На этапе практики были отработаны профессиональные навыки:
По пробоподготовке библиотек с использованием оригинальных реактивов компаний Illumina и Oxford, Nanopore. Оценки качества, получаемых библиотек, посредством использования биоанализатора компании Agilent. Загрузки приборов для  высокопроизводительного секвенирования. Завершения работы приборов, промывки, обслуживания.

По результатам прохождения стажировки были выданы удостоверения о повышении квалификации государственного образца.